O Centro Social Paroquial São Sebastião é uma Instituição ereta canonicamente pelo Bispo de Setúbal, D. Gilberto Canavarro dos Reis, em 07.10.1998, por pedido do Conselho Pastoral da Paróquia de São Sebastião de Setúbal.
No entanto, iniciou a sua ação social nos anos 80, com a vontade do Sr. Padre Álvaro Teixeira, que criou, a título informal, um centro de ocupação de tempos livres, situado no bairro da Conceição, dirigido a crianças carenciadas, identificadas pela comunidade.
Tendo-se constituído como Instituição Particular de Solidariedade Social, com sede no Largo de São Domingos, em Setúbal, reconhecida como Instituição de Utilidade Pública, a 10 de novembro de 1998, desenvolveu o projeto de luta conta a pobreza, financiado pela Segurança Social, Desenvolver e Florescer, com ação junto das crianças e idosos do bairro de São Domingos, que originou a criação do Centro Comunitário São Sebastião em 2006, com a assinatura de Acordo de Cooperação com o Centro Distrital da Segurança Social de Setúbal.
Começava assim uma nova era, com a resposta estruturada de apoio às crianças, jovens e idosos, mas também à comunidade, com acompanhamento psicossocial às famílias e promoção de atividades de intervenção comunitária.
Ao longo dos anos foi desenvolvendo respostas integradas que procuraram responder às necessidades efetivas da população, respondendo também à satisfação das necessidades básicas ao nível da alimentação e vestuário.

Em 2022 foi reconhecido com a atribuição da Medalha de Honra da cidade de Setúbal, pelos serviços prestados aos mais carenciados, numa cerimónia decorrida no dia 15 de setembro de 2022, no Fórum Luísa Todi.